如何利用生物信息学筛选目的lncrna
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浏览3次2024-05-20最佳答案
第1个回答
给你一个大致的筛选标准：（领差段集目挥龙行功是1）选择长度≥200得功庆复江bp，Exon个数≥2的转录本；（2）通过计算每条转录来自本的Reads覆盖度，选择Reads最小覆盖度≥3的转录本；（3）去除已知的mRNA转录本(通过和已有注释文件比对)（4）去除已知的非编附稳半婷行攻品克码RNA转录本（比对一些已有的lncRNA数据库了）（5）去除有蛋白家族的转录本（能够注释到Pfam数据库）；（6）去除有编码潜能的RNA（CNCI，CPC，这两款软件都可以给出一个编码能力的预测）
希望360知道的回答，能够帮助到你。
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